湄洲妈祖祖庙位于莆田市秀屿区湄洲镇宫下村东北面。湄洲妈祖祖庙的寝殿、正殿和圣父母祠是祖庙建筑群的主要建筑，是妈祖信仰在祖庙的主要载体。寝殿，占地面积238平方米，建于宋雍熙四年（987）。明洪武七年（1374）泉州卫指挥周坐重建，永乐初和宣德六年（1431）郑和重修，康熙二十二年（1683）姚启圣和康熙二十三年（1684）施琅均以重修，民国年间再度在旧址重修。单檐歇山顶，面阔三间、进深二间，前额保存民国初重修时的墨书，沿用部分明、清石柱和柱础。正殿，明永乐初（1403）郑和奉旨遣官建造，原为朝天阁，清康熙二十二年（1683）闽浙总督姚启圣获妈祖保佑建功而扩建祖庙时把朝天阁重修并改为正殿，为重檐歇山顶、面阔三间、进深三间的抬梁结构建筑。圣父母祠，南宋建、明代重建、清代重修，正堂为悬山顶，面阔三间、进深一间，保存宋代天井。

2009年9月30日，联合国教科文组织政府间保护非物质文化遗产委员会经审议表决，决定将由莆田湄洲岛管委会和湄洲妈祖祖庙董事会联合申报的《妈祖信俗》列入世界级非物质文化遗产代表名录。

首个世界性妈祖社团组织的落址单位。国家批准的首个世界性妈祖文化社团“中华妈祖文化交流协会”2004年在湄洲岛妈祖祖庙成立。“中华妈祖文化交流协会”的成立，标志着妈祖信仰正式被界定为妈祖文化，具有里程碑意义。祭祀规格的妈祖宫庙。祖庙的“妈祖祭祀”、山东的“孔子祭祀”和陕西的“黄帝祭祀”并称为中国三大传统祭典，祖庙“妈祖祭祀大典”是中国首批“非物质文化遗产”，湄洲岛每年都要举办朝拜妈祖祭祀大典。祭典场面气势磅礴，恢宏壮观，主祭人为中华妈祖文化交流协会副会长或秘书长。湄洲妈祖祖庙是祭祀规格的妈祖宫庙。

建设规模最庞大的妈祖庙。始建于987年的湄洲妈祖祖庙历经多次重修和扩建，已成为规模宏大的庙宇建筑群，特别是祖庙的南中轴线庙宇群，全长323米，宽99米，其中天后正殿高19米，宽50米，进深30米，面积987米，可同时容纳千人朝拜，正中供奉8米高的妈祖座像，陪侍的有妇幼保护女神陈靖姑和兴建宋代著名水利工程木兰陂的女杰钱四娘以及航海家郑和、收复台湾的施琅将军等八大神像。殿前的天后广场面积达10000多平方米，还有一座高26.5米的大戏台，是祖庙举行盛大活动的场所，两旁的观礼台及回廊能容万名观众。而高19米，宽33米，五开间的山门大牌坊则是我国少见的雄伟牌坊之一。